pathogenicity and genetic diversity among the strains of clavibacter michiganensis subsp. insidiosus causing alfalfa wilt disease, hamedan province

[ ' a l f a l f a ( m e d i c a g o s a t i v a ) i s a m o n g a f e w o f t h e m o s t i m p o r t a n t f o r a g e c r o p s f o r t h e g r o w t h o f w h i c h h a m e d a n p r o v i n c e b e n e f i t s f r o m a s u i t a b l e c l i m a t e . a l f a l f a b a c t e r i a l w i l t d i s e a s e i n d u c e d b y c l a v i b a c t e r m i c h i g a n e n s i s s u b s p . i n s i d i o s u s c a u s e s u b s t a n t i a l e c o n o m i c c r o p l o s s e s . t h i s d i s e a s e h a s n o t b e e n s o f a r i n v e s t i g a t e d e x t e n s i v e l y i n h a m e d a n p r o v i n c e . i n t h e c o u r s e o f t h i s s u r v e y a f f e c t e d p l a n t s a m p l e s w e r e c o l l e c t e d f r o m a l f a l f a g r o w i n g a r e a s i n h a m e d a n p r o v i n c e ' , ' a n d c a u s a t i v e b a c t e r i a l a g e n t s i s o l a t e d . p a t h o g e n i c i t y o f t h e s t r a i n s w a s c o n f i r m e d o n p l a n t s a n d t h e i r p h e n o t y p i c f e a t u r e s c h a r a c t e r i z e d a s b a s e d o n s t a n d a r d b a c t e r i o l o g i c a l m e t h o d s . b a c t e r i a l s t r a i n s i n d u c e d s y m p t o m s o n t e s t e d a l f a l f a p l a n t s a f t e r a p a s s a g e o f 4 0 d a y s . p a t h o g e n i c s t r a i n s w e r e i d e n t i f i e d a s c . m . s u b s p . i n s i d i o s u s . e f f e c t o f t h e s t r a i n s o n s h o o t a n d r o o t l e n g t h ' , ' w e t a n d d r y w e i g h t o f t h e p l a n t p a r t s w e r e e v a l u a t e d i n a r a n d o m i z e d d e s i g n i n f o u r r e p l i c a t e s . t h e o b t a i n e d d a t a w e r e a n a l y z e d t h r o u g h s a s s o f t w a r e . r e s u l t s i n d i c a t e d t h a t a l l t h e t e s t e d s t r a i n s r e d u c e d t h e a b o v e ' , ' m e n t i o n e d t r a i t s s h o w i n g s i g n i f i c a n t d i f f e r e n c e s i n t h i s r e g a r d . t o d e t e r m i n e o f t h e g e n e t i c d i v e r s i t y a m o n g t h e t e s t e d s t r a i n s o p a ' , 3 , ' o p a ' , 1 5 , ' o p b ' , 1 0 , ' o p b ' , 1 5 , ' o p b ' , 1 8 , ' o p b ' , 2 0 , ' o p e ' , 1 , ' o p e ' , 2 , ' o p e ' , 3 , ' o p e ' , 4 , ' o p e ' , 7 , ' o p e ' , 1 4 , ' o p e ' , ' 1 6 a n d o p e ' , ' 1 9 p r i m e r s w e r e p i c k e d u p a n d c l u s t e r i n g w a s p e r f o r m e d . r e s u l t s r e v e a l e d f o u r c l u s t e r s c o m p a r i s e d o f : a h 7 ' , ' a h 8 ' , ' a h 9 a n d a h 6 s t r a i n s ( f i r s t c l u s t e r ) ' , ' a h 1 5 a n d a h 2 s t r a i n s ( s e c o n d c l u s t e r ) ' , ' a h 1 0 ' , ' a h 1 1 ' , ' a h 1 2 a n d a h 1 4 s t r a i n s ( t h i r d ) ' , ' a n d a h 1 a n d a h 3 ( f o u r t h c l u s t e r ) . e c o r 1 d i g e s t i o n o f t h e a m p l i f i e d f r a g m e n t u s i n g c i r s ' , ' 1 a n d c i r s ' , ' 2 p r i m e r s r e v e a l e d t w o g r o u p s o f s t r a i n s . a l l t h e o b t a i n e d d a t a r e v e a l e d g e n e t i c d i v e r s i t y a m o n g t h e c . m . s u b s p . i n s i d i o s u s s t r a i n s c o l l e c t e d f r o m h a m e d a n p r o v i n c e . ' ]